本系博士班旨在發展具有宏觀視野的教育專業研究人才。課程規劃依下述二原則：（一）透過共同必修課程，厚植研究生扎實之理論基礎及研究方法之專精訓練，培養思維能力與廣博之視野。（二）發展分組專精課程，本系博士班目前設有五組專精課程：課程與教學組、教育心理與輔導組、哲史與社會學組、幼兒教育組、特殊教育組等，以分別培養研究生之各類專長。本系博士班積極整合校內外教育資源，建構學術與實務社群，並吸取國際學術與教育研究之精華，以期師生在教學、研究、服務和推廣等方面發揮教育學術與人才培育之影響力。